Assignatura
Bioinformàtica
- codi 11718
- curs 1
- període Anual
- tipus OB
- credits 1
Llengua d'impartició principal: anglès
Altres llengües d'impartició: català, castellà
Professorat
Responsable
Dr. Pau Marc MUÑOZ - pmunoz@uic.es
Horari d'atenció
L'estudiant ha de contactar per correu electrònic per concretar cita
Dr. Pau Marc Muñoz Torres (pmunoz@uic.es)
Presentació
La bioinformàtica és una àrea d'investigació on s'apliquen les ciències de la computació i les tecnologies de la informació per al tractament de dades biològiques. Aquesta disciplina és intrínsecament transversal, és aplicable a tots els àmbits de les ciències de la vida i la salut, incloent-hi la genòmica, la proteòmica o les xarxes gèniques i metabòliques. Els camps sobre els quals té un impacte clau són molt diversos i cada vegada més especialitzats, el que respecte dels bioinformàtics un professional escàs i molt valorat. L'ingent volum de dades que els diferents camps de la biomedicina generen fan necessari l'ús i aprofitament de tècniques computacionals , la qual cosa converteix la bioinformàtica en una ciència essencial i protagonista per a la transformació d'aquesta allau de dades en coneixement. Gestionar de forma àgil i natural tota aquesta informació suposa un dels majors reptes biocientífica actuals i abasta des del disseny de bases de dades i algoritmes per a emmagatzemar i analitzar la informació a la creació de xarxes i models que integren tota la informació disponible.
Requisits previs
Objectius
- Identificar els diferents àmbits que engloba la paraula " bioinformàtica " .
- Conèixer i manipular les principals bases de dades públiques moleculars .
- Introducció al disseny in - silico de biomolècules
Competències / Resultats d’aprenentatge de la titulació
- CB10 - Adquirir habilitats d'aprenentatge que els permetin continuar estudiant de manera autodirigida i autònoma.
- CB6 - Posseir i comprendre coneixements que aportin una base o oportunitat de ser originals en el desenvolupament i / o aplicació d'idees en un context d'investigació.
- CB7 - Aplicar els coneixements adquirits, i desenvolupar la seva capacitat de resolució de problemes en entorns nous o poc coneguts dins de contextos més amplis (o multidisciplinaris) relatius al seu camp d'estudi.
- CB8 - Integrar coneixements i enfrontar-se a la complexitat de formular judicis basats en l'evidència científica, a partir d'una informació que, tot i que pot ser incompleta o limitada, inclogui reflexions sobre les responsabilitats socials i ètiques vinculades a l'aplicació dels seus coneixements i judicis.
- CB9 - Comunicar les conclusions, els coneixements i les raons últimes que les sustenten a públics especialitzats i no especialitzats d'una manera clara i sense ambigüitats.
- CE10 - Saber aplicar els fonaments epistemològics, ètics, legislatius i humanitaris en l'exercici de la investigació i en la difusió dels resultats.
- CE4 - Aplicar els models d'experimentació animal així com la metodologia de la manipulació animal i els seus conceptes ètics en la recerca en odontologia.
- CE9 - Saber aplicar els últims avenços tecnològics en la recerca en odontologia, tenint-ne en compte les propietats, les indicacions, la biocompatibilitat, la toxicitat i l'impacte ambiental.
- CG1 - Habilitat per integrar els nous coneixements adquirits mitjançant la investigació i l'estudi, i fer front a la complexitat.
- CG2 - Capacitat crítica d'anàlisi i discussió dels resultats experimentals, així com d'emetre'n les conclusions corresponents.
- CG3 - Capacitat d'autoaprenentatge en el desenvolupament de noves tècniques instrumentals, en l'adquisició de nous conceptes científics, i en la recerca de nova informació científica.
- CG4 - Capacitat d'argumentar i defensar idees científiques pròpies així com d'escoltar, analitzar, valorar i donar resposta a les idees d'una altra persona.
- CT1 - Capacitat d'integració en un equip de treball establert, multidisciplinar i multicultural.
Resultats d’aprenentatge de l’assignatura
- Dissenya adequadament estudis experimentals / no experimentals i coneix els principis bàsics dels estudis qualitatius .
- Té coneixement dels últims avenços en el camp d'interès escollit .
- Integra la investigació experimental amb les possibilitats assistencials i terapèutiques .
Continguts
Tema 1 GENÓMICA
1.1 Tècniques de seqüenciació de nova generació i l'anàlisi de les dades produïdes : des del acoblament a l'anotació i l'anàlisi funcional.
1.2 Variació present en el genoma : variació nucleotídica i variació estructural
1.3 Navegadors genòmics.
1.4 Estudis d'associació que relacionen la variabilitat genètica amb el fenotip .
1.5 Eines d'anàlisi bioinformàtica (recerca per similitud i alineament de múltiples seqüències ) i la seva aplicació.
Tema 2 PROTEÓMICA
2.1 Conceptes bàsics de la biologia estructural .
2.2 Estratègies comunes en l'anàlisi de proteïnes : identificació i estudi o predicció de l'estructura
Tema 3 BIOLOGIA DE SISTEMES
3.1 Estudio de redes y la utilización de modelos.
Tema Material didàctic: Proporcionat pel professor a la plataforma Moodle
Metodologia i activitats formatives
Modalitat totalment presencial a l'aula
Metodologia: CM, MC, TRB
Activitats formatives: CT (1 ECTS)
Sistemes i criteris d'avaluació
Modalitat totalment presencial a l'aula
avaluació contínua - EC (20%)
Resolució de casos - RC (30%)
prova final - PFE (50%)
Bibliografia i recursos
Universitat Internacional de Catalunya - Barcelona