Universitat Internacional de Catalunya
Fundamentos del Ecosistema Computacional
Otras lenguas de impartición: catalán, castellano
Profesorado
Presentación
El objetivo de esta asignatura es proporcionar al estudiante el conocimiento básico de los
sistemas informáticos necesario para la práctica cotidiana de la bioinformática. El alumno
aprenderá aspectos básicos de los sistemas operativos y gestión de bases de datos necesarios
para ejecutar los proyectos bioinformáticos, particularmente aquellos asociados a la aplicación
de técnicas experimentales masivas (secuenciación, RNAseq, etc) habituales en el entorno
biomédico. No se requieren conocimientos previos en la materia.
Requisitos previos
Se recomienda haber cursado y superado:
- Introducción a la bioinformática
Objetivos
Entender los aspectos básicos de los computadores, sistemas operativos y las nociones
de bases de datos necesarias para ejecutar proyectos bioinformáticos.
Competencias/Resultados de aprendizaje de la titulación
BÁSICAS
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CB1 |
Que los estudiantes hayan demostrado poseer y comprender conocimientos en un área de estudio que parte de la base de la educación secundaria general, y se suele encontrar a un nivel que, si bien se apoya en libros de texto avanzados, incluye también algunos aspectos que implican conocimientos procedentes de la vanguardia de su campo de estudio |
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CB3 |
Que los estudiantes tengan la capacidad de reunir e interpretar datos relevantes (normalmente dentro de su área de estudio) para emitir juicios que incluyan una reflexión sobre temas relevantes de índole social, científica o ética |
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CB5 |
Que los estudiantes hayan desarrollado aquellas habilidades de aprendizaje necesarias para emprender estudios posteriores con un alto grado de autonomía |
GENERALES
CG11Reconocer conceptos básicos de diferentes ámbitos vinculados a las ciencias biomédicas.
ESPECÍFICAS:
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CE19 |
Reconocer los principios de las ciencias biomédicas relacionadas con la salud y aprender a trabajar en cualquier ámbito de las Ciencias Biomédicas (empresa biomédica, laboratorios de bioinformática, laboratorios de investigación, empresa de análisis clínicos, etc.) |
TRANSVERSALES
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CT1 |
Desarrollar la capacidad de organización y planificación adecuadas al momento. |
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CT2 |
Desarrollar la capacidad para la resolución de problemas. |
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CT3 |
Desarrollar la capacidad de análisis y síntesis. |
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CT5 |
Usar internet como medio de comunicación y como fuente de información. |
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CT10 |
Ser capaz de llevar a cabo un aprendizaje autónomo. |
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CT11 |
Aplicar los conocimientos teóricos a la práctica. |
Resultados de aprendizaje de la asignatura
Como resultado de aprendizaje específico de este curso se contempla el siguiente:
- El alumno conoce los principios básicos de la interacción con, y uso científico de, los ordenadores y de la estructuración de la información.
Contenidos
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The computer
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The hardware
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The operating system
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Data, files and the cloud
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Using a computer
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Installing software. Generating files. Office software. Structuring a project with folders
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The command line: terminal, navigation, permissions
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Working with data
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Command line: cat, awk, grep, sed...
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Files + Cloud = API
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Scripting
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Excel
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Project: Working with data
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Working with a computer
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Introduction to databases
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Data transformations
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Professional work tools: programming, git, testing, libraries, deploying, data review
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Group project
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Group project correction and questions
Metodología y actividades formativas
Modalidad totalmente presencial en el aula
Clases magistrales: exposición durante 2 horas en bloques de 50 minutos, de un tema teórico por parte del profesor.
Casos clínicos o métodos del caso (MC): Planteamiento de una situación real o imaginaria. Los alumnos trabajan las preguntas formuladas en grupos reducidos o en interacción activa con el profesor y se discuten las respuestas. El profesor interviene activamente y si hace falta aporta nuevos conocimientos.
Educación virtual (EV): Material online que el alumno puede consultar desde cualquier ordenador, a cualquier hora y que contribuirá al autoaprendizaje de conceptos relacionados con la asignatura.
Sistemas y criterios de evaluación
Modalidad totalmente presencial en el aula
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Alumnos en primera convocatoria:
Examen final: 60%
Participación en clase, ejercicios y cuestionarios: 40%
Alumnos en segunda o posterior convocatoria: Los alumnos repetidores en 3ª o 5ª convocatoria podrán decidir mantener la nota de participación anterior, comunicándolo previamente al profesor. En caso de obtener menos nota de participación, se mantendrá la nota anterior.
Puntos generales a tener en cuenta sobre el sistema de evaluación:
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Para poder hacer media, en el examen final se deberá obtener un 5 de nota mínima.
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Además de lo mencionado anteriormente, para aprobar la asignatura, la media de todas las calificaciones ha de ser 5 o superior.
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El carácter continuado de esta evaluación hace que no sea posible evaluar la asignatura si no se ha participado en un 75% de las horas.
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El uso indebido de aparatos electrónicos (como el registro y difusión tanto del alumnado como del profesorado durante las diferentes sesiones, así como el uso de estos aparatos con fines lúdicos y no educativos) puede comportar la expulsión de clase.
Periodo de evaluación
- E1 16/01/2024 A10 14:00h
- R1 24/01/2024 A10 18:00h