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El Departamento de Ciencias Biomédicas impulsa un proyecto pionero para estudiar cómo la forma del ARN determina su función biológica
Uciel Chorostecki, investigador Ramón y Cajal del Departamento de Ciencias Biomédicas de UIC Barcelona, lidera un proyecto financiado en el marco del programa Proyectos de Generación del Conocimiento 2024 y que tiene como objetivo principal descifrar cómo la estructura secundaria del ARN largo no codificante (lncRNA) determina su función biológica, más allá de las diferencias en su secuencia genética
UIC Barcelona ha obtenido una ayuda competitiva del programa Proyectos de Generación del Conocimiento 2024 por un importe de 106.250 € para el proyecto “Dinámica evolutiva de la conservación estructural y funcional en lncRNAs”*. Liderado por el investigador y docente del Departamento de Ciencias Biomédicas, el proyecto también cuenta con la participación de los investigadores Jorge Pérez y Nicolás Aira, del mismo departamento.
El proyecto tiene como premisa fundamental el hecho de que las moléculas de lncRNA pueden tener secuencias muy diferentes entre especies, pero conservar la misma función biológica. “Esto sugiere que la clave de su papel funcional no reside tanto en la secuencia, sino en su estructura secundaria o “forma””, explica Uciel Chorosteki.
Para comprender la forma funcional del lncRNA, “nuestro objetivo es aplicar y perfeccionar (fine-tuning) una herramienta de inteligencia artificial que ya estamos desarrollando. Esta nos permitirá estudiar la conservación evolutiva de lncRNAs distantes, e identificar similitudes estructurales y funcionales incluso cuando sus secuencias no se parezcan en nada” detalla el investigador. “Esto no solo aportará nuevos conocimientos sobre cómo funciona el ARN, sino que también abrirá nuevas vías para el desarrollo de terapias más precisas contra enfermedades como el cáncer”.
A lo largo del proyecto de investigación, el equipo de Chorostecki combinará experimentos de laboratorio avanzados con modelos de inteligencia artificial capaces de comparar directamente las formas del ARN, “una tarea que hasta ahora resultaba muy compleja con los métodos computacionales tradicionales” como señalan los investigadores.
Los ARN largos no codificantes (lncRNA) desempeñan un papel esencial en la regulación de la expresión génica y, aunque se sabe que están implicados en numerosos procesos biológicos y enfermedades, su función sigue siendo poco conocida debido a la falta de herramientas eficaces para estudiarlos. El proyecto liderado por Chorostecki permitirá identificar entre miles de lncRNA aquellos que podrían tener funciones relevantes en el organismo humano.
“De los aproximadamente 40.000 genes no codificantes del genoma humano conocidos hasta el momento, conocemos la función de solo una pequeña fracción. Con esta herramienta podremos hacer un cribado sistemático y detectar cuáles son potencialmente funcionales”, añade el investigador.
La ayuda competitiva recibida por el proyecto liderado por Uciel Chorostecki supone para UIC Barcelona un paso adelante para impulsar proyectos que combinan biología molecular, inteligencia artificial y medicina traslacional con la voluntad de dar respuesta a los grandes retos de la salud global.
*PID2024-158673NA-I00, financiado por MICIU/AEI/10.13039/501100011033 y por el FSE+
