El Módulo 3 lo constituye el protocolo de investigación y el trabajo de fin de máster. Este módulo ocupa aproximadamente la mitad de los créditos ECTS del máster, debido a que en este módulo se integran de forma práctica la mayoría de las capacidades necesarias para iniciarse en el campo de la investigación y evalúan de forma integrada las competencias necesarias para posteriormente incorporarse a un programa de doctorado.

Durante el 1er semestre de máster, éste módulo abarca 8 créditos ECTS dirigidos a consolidar los principios de la metodología científica para el diseño de un proyecto de investigación conducente al trabajo fin de máster. Durante el 2osemestre, el módulo 3 tiene una carga de 16 créditos ECTS, debido a que el alumno ejercita unas competencias metodológicas que le permitirán llevar a cabo la parte práctica de la investigación, desarrollando de manera activa el trabajo de fin de máster.