Universitat Internacional de Catalunya
Microbiología Clínica
Otras lenguas de impartición: catalán, inglés
Profesorado
Las dudas serán resueltas preferiblemente antes o después de clase.
Contacto profesores de la asignatura:
Profesor coordinador: Joan Marc Martínez Láinez (mlainez@uic.es)
Departamento de Ciencias Biomédicas / Área Microbiología
Profesora Clases teóricas: Nuria Prim (nprim@uic.es)
Profesora MCs: Judith Lucena (jclucena@uic.es)
Presentación
Después de haber realizado la introducción al amplio mundo de la microbiología general, la asignatura Microbiología Clínica pretende profundizar tanto en los procesos de interacción entre los microorganismos y el ser humano como en las técnicas de diagnóstico microbiológico y en el control de la infección, todo ello enmarcado en un enfoque sindrómico de las enfermedades infecciosas.
La asignatura contribuye a los Objetivos de Desarrollo Sostenible (ODS) de la Agenda 2030, especialmente a los ODS 3, 4, 9, 10, 12 y 17, mediante la promoción de la salud y el bienestar (ODS 3), la garantía de una educación de calidad (ODS 4), el fomento de la innovación científica y tecnológica (ODS 9), la reducción de desigualdades mediante el acceso equitativo al conocimiento (ODS 10), la promoción de un uso responsable de recursos en el ámbito biomédico (ODS 12) y el impulso de alianzas científicas y académicas para el progreso social (ODS 17).
Requisitos previos
Se considera indispensable haber cursado la asignatura Microbiología (primer curso) ya que importante repasar y consolidar los conceptos generales aprendidos en esta, ya que podrían ser evaluados a lo largo de la asignatura. Se requieren conocimientos generales de biología celular y biología molecular, anatomía, histología y fisiología.
Objetivos
1. Explicar las características morfológicas, fisiológicas y los ciclos biológicos de los principales microorganismos causantes de enfermedades en el ser humano, diferenciando patógenos de comensales y describiendo la microbiota normal y sus funciones fisiológicas.
2. Describir los reservorios de los microorganismos y explicar sus vías de transmisión.
3. Analizar los mecanismos de patogenicidad y los factores de virulencia que contribuyen a la capacidad patógena de los microorganismos.
4. Exponer la fisiopatología de la infección, explicando la relación agente patógeno-huésped, enseñando los mecanismos de defensa y definiendo el concepto de oportunismo.
5. Presentar las principales síndromes clínicas asociadas a los diferentes agentes etiológicos.
6. Enseñar las distintas técnicas microbiológicas para el diagnóstico etiológico de las enfermedades infecciosas, transmitiendo el conocimiento sobre el uso y procesamiento de muestras clínicas y el estudio de sensibilidad a los antibióticos.
7. Proporcionar las medidas básicas para la prevención y el control de infecciones, describiendo los diferentes antimicrobianos, explicando los conceptos de resistencia y definiendo la infección nosocomial así como las técnicas para el estudio de brotes.
Competencias/Resultados de aprendizaje de la titulación
- CN11 - Identificar el impacto de la microbiología, la genética y la bioquímica en la salud humana, así como las herramientas de diagnóstico empleadas en cada uno de los ámbitos de la Salud.
- CP02 - Interpretar datos prácticos o teóricos aplicando la metodología científica mediante la evaluación de situaciones y resultados desde un punto de vista crítico y constructivo.
- CP05 - Aplicar los fundamentos biológicos en la búsqueda de soluciones prácticas a problemas en el ámbito de la salud, siguiendo las normas éticas y de rigor científico y respetando los derechos fundamentales de igualdad entre hombres y mujeres, y la promoción de los derechos humanos y los valores propios de una cultura de paz y de valores democráticos que incluyen el fomento de un lenguaje inclusivo, no discriminatorio y libre de estereotipos.
- HB05 - Interpretar el mecanismo de acción de los principales fármacos y su capacidad para modificar la actividad biológica.
- HB06 - Calcular la frecuencia y distribución de las enfermedades, sus causas y determinantes, así como las intervenciones necesarias para mantener o restaurar la salud.
Resultados de aprendizaje de la asignatura
Al acabar el curso, el alumnado debe:
● Identificar los mecanismos de patogenicidad y los cuadros clínicos asociados a los principales patógenos humanos.
● Describir las principales pruebas de diagnóstico de enfermedades infecciosas. Sabrá qué técnicas microbiológicas concretas pueden aplicarse en cada contexto clínico.
● Identificar los reservorios y las vías de transmisión de los microorganismos de interés en medicina. Conocerá las medidas básicas para la prevención y el control de las infecciones.
● Analizar la estructura, ciclo vital y mecanismos de acción de bacterias, virus, hongos y parásitos de relevancia clínica, relacionándolos con sus manifestaciones patológicas.
● Relacionar los distintos grupos de microorganismos con los síndromes infecciosos que producen, considerando factores del hospedador, microorganismo y contexto epidemiológico.
● Reconocer el papel de la microbiota humana en la salud y la
enfermedad, diferenciando entre flora comensal, patógena y oportunista.
Contenidos
El temari inclou el contingut fonamental de la Microbiologia Clínica (Bacteriologia, Micologia, Virologia, Parasitologia). Les síndromes clíniques (bloc VI) s’ensenyaran de manera transversal i s’ampliaran en mètodes del cas.
Bloc I. Introducció a la Microbiologia Clínica
Introducció. Relació hoste-paràsit. Reservori i transmissió. Mecanismes de patogenicitat i de defensa. Diagnòstic microbiològic de les infeccions. Mesures de prevenció i control.
Bloc II. Bacteriologia
Bacteriologia clínica. Conceptes bàsics. Factors de virulència. Diagnòstic microbiològic. Antibiòtics.
Cocs grampositius en raïm. Staphylococcus aureus. Estafilococs coagulasa negativa.
Cocs grampositius en cadenes. Streptococcus pyogenes. Streptococcus agalactiae. Streptococcus pneumoniae. Estreptococs del grup viridans. Enterococcus.
Cocs gramnegatius. Neisseria.
Bacils gramnegatius (part 1). Enterobacterales.
Bacils gramnegatius (part 2). Pseudomonas aeruginosa. Bacils corbats (Campylobacter, Helicobacter, Vibrio). Bacils nutritivament exigents (Legionella, Brucella, Bordetella, Haemophilus).
Bacils grampositius. Corynebacterium diphtheriae. Bacteris corineformes. Listeria monocytogenes. Lactobacillus. Bacils esporulats (Bacillus).
Bacteris anaerobis. Característiques generals. Esporulats (Clostridium/Clostridioides) i no esporulats.
Bacteris amb característiques especials. Mycobacterium, espiroquetes (Treponema), micoplasmes, clamídies, rickèttsies.
Bloc III. Micologia
Micologia clínica. Conceptes bàsics. Classificació. Patogènesi. Diagnòstic microbiològic. Antifúngics.
Llevats en infeccions oportunistes. Candida. Cryptococcus. Altres
Fongs filamentosos en infeccions oportunistes. Fongs superiors (Aspergillus) i inferiors (zigomicets).
Fongs dimòrfics Histoplasma capsulatum i altres
Dermatòfits.
Bloc IV. Virologia
Virologia clínica. Conceptes bàsics. Patogènesi. Diagnòstic microbiològic. Antivírics.
Virus RNA sense embolcall. Picornavirus (Enterovirus). Virus causants d’enteritis (rotavirus, norovirus).
Virus DNA sense embolcall. Adenovirus. Papillomavirus. Parvovirus.
Virus DNA amb embolcall. Herpesvirus. Altres virus.
Virus RNA amb embolcall. Orthomyxoviridae. Paramyxoviridae. Altres virus.
Virus de les hepatitis. Característiques dels diferents virus de l’hepatitis.
Altres virus d’interès. Retrovirus (virus de la immunodeficiència humana). Arbovirus.
Bloc V. Parasitologia
Parasitologia clínica. Conceptes bàsics. Protozous (amebes, flagel·lats, ciliats, apicomplexos) i helmints (platihelmints, nematodes). Cicles vitals. Patogènesi. Diagnòstic microbiològic. Prevenció i control.
Protozoosis. 1) Intestinals (Entamoeba histolytica, Giardia, Cryptosporidium); 2) genitals (Trichomonas); 3) sistèmiques (Trypanosoma, Leishmania, Plasmodium, Toxoplasma).
Helmintiasis. 1) Platihelmints (tènies, esquistosomes); 2) Nematodes intestinals (Ascaris, Strongyloides, oxiürs); 3) Nematodes hemotissulars (filàries, Trichinella).
Bloc VI. Diagnòstic microbiològic dels síndromes infecciosos
Bacterièmia, fungèmia, sèpsia. Infeccions de pell i parts toves. Infeccions del sistema nerviós. Infeccions del tracte urinari. Enteritis. Infeccions respiratòries. Infeccions de transmissió sexual. Infeccions osteoarticulars. Infeccions polimicrobianes. Síndrome de la immunodeficiència adquirida. Hepatitis.
Mètodes del Cas
- Estudi de la sensibilitat als antimicrobians (antibiograma). Bacteris multiresistents. Infecció nosocomial.
- Bacterièmia i sèpsia.
- Enteritis.
- Activitat de recapitulació (posada en comú) .
Metodología y actividades formativas
Modalidad totalmente presencial en el aula
La metodología y los recursos docentes que emplearemos en la presente asignatura son los siguientes:
Clases magistrales (CM) (20 horas): exposición en dos bloques de 50 minutos (separados por un descanso de 10 minutos). Las exposiciones del tema teórico se realizarán por parte del profesorado con soporte audiovisual. El alumnado dispondrá de los contenidos con anterioridad a través de la red informática interna.
Casos clínicos o métodos del caso (MC) (8 horas): planteamiento de una situación real o imaginaria con la finalidad de revisar y discutir con el alumnado los principios básicos del diagnóstico etiológico de las enfermedades infecciosas. El alumnado trabaja las preguntas formuladas en grupos reducidos o en interacción activa con el profesorado y posteriormente se discuten las respuestas. El profesorado interviene activamente y si hace falta aporta nuevos conocimientos.
Educación virtual (EV): material en línea ubicado en la plataforma Moodle que el alumnado puede consultar desde cualquier ordenador, a cualquier hora, y que contribuirá al autoaprendizaje de conceptos relacionados con la asignatura. El material virtual forma parte del contenido de la asignatura y será evaluado en el examen final.
El conjunto de la educación virtual engloba tanto el foro de la asignatura como el material en línea antes mencionado.
Lengua principal de impartición: castellano. Otras lenguas de impartición: catalán e inglés.
Sistemas y criterios de evaluación
Modalidad totalmente presencial en el aula
Alumnado en primera convocatoria:
La nota final de la asignatura se calculará sumando las notas de:
- Examen parcial tipo test que determinará el 15 %
- Examen final que determinará el 55 % del total de la nota final.
- Nota de los casos clínicos: 20 %
- Participación: 5 %
- Actividad grupal (recapitulación): 5%
Alumnado en segunda convocatoria o posterior:
La nota de evaluación continua se guardará y mantendrá con sus porcentajes originales, aunque el alumnado podrá repetir la asistencia a las diferentes metodologías y obtener una nueva nota siempre que lo desee.
Puntos generales que tener en cuenta sobre el sistema de evaluación:
1) En el examen final se deberá obtener un 5 como nota mínima para poder realizar la media con las otras notas. Para aprobar la asignatura será necesario obtener una nota global igual o superior a 5 sobre 10.
2) El examen parcial no liberará materia para el examen final.
3) Los exámenes serán de tipo test con cuatro opciones de respuesta de las que solo una será correcta. Las preguntas no contestadas no sumarán ni restarán. Cada pregunta mal contestada restará el equivalente al 33 % del valor de una correctamente contestada.
4) El examen final incluirá también una o más preguntas cortas de desarrollo además de las preguntas tipo test. Son voluntarias. Pueden añadir hasta un máximo de 0,5 puntos a la nota del examen final. En casos excepcionales de una calidad de respuesta excelente en estas preguntas, el profesor podrá ampliar el valor de estas.
5) La asistencia a métodos del caso es obligatoria para optar al 20 %. Se admite una falta injustificada (la nota será un 0 en el MC), y en caso de justificación oficial (normativa de la UIC) el MC no se tendrá en cuenta para la nota final.
6) La asistencia a las clases teóricas no es obligatoria. Los asistentes se tendrán que regir por las normas que indique el profesorado. En caso de no llegar puntual, se entrará en silencio sin molestar ni interrumpir en clase.
7) Por participación en clase se considerará responder a las preguntas planteadas por el profesorado. Parte de la participación en las clases magistrales se evaluará a través de un pequeño cuestionario (vía Moodle); se requerirá la realización de un 50 % mínimo de cuestionarios para que la calificación obtenida en esta evaluación se considere en la nota global.
8) La actividad grupal es obligatoria. En esta actividad se busca que los alumnos sean capaces de recapitular, deducir e integrar una serie de conceptos que se habrán trabajado transversalmente a lo largo de la asignatura.
9) El alumnado con una participación activa y una actitud brillante pueden optar al +10 % de excelencia (sobre el 100 % de la nota final).
10) Todas las partes de la asignatura que no sean el examen final se considerarán como evaluación continua.
Bibliografía y recursos
Bibliografía
Prats G. Microbiología y Parasitología médicas. 2ª ed. Madrid. Editorial Médica Panamericana.
2023.
Bibliografía adicional
Murray PR, Rossental KS, Pfaller MA. Microbiología médica. 9ª ed, Elsevier. 2021.
Mandell GL, Bennet JE, Dolin R. Enfermedades infecciosas: principios y práctica: Mandell,
Douglas y Bennett. 7ª ed. Elsevier. 2012.
Engleberg NC, DiRita VJ, Dermody TS. Schaechter's Mechanisms of Microbial Disease. 6th
ed., Wolters Kluwer Health. 2021.
Enlaces de interés
Centers for disease control and prevention (www.cdc.gov)
American Society for Microbiology (www.asm.org)
Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (https://seimc.org/ )